復合土工膜常用在水電、堤壩、交通、市政等工程項目，在施工中，因為工程現場較大的施工面積，復合膜本身的整體尺寸很難做到整體覆蓋，所以免不了要在施工中進行搭接施工，將多卷復合膜接合為一個大的整體，以獲得良好的效果。

通常在復合土工膜的生產中，為方便后續的搭接施工，通常會在縱向或者橫向預留八厘米至十厘米的甩邊，甩邊部分的土工膜和土工織物是主動分開的，以便后續在寬度和長度上搭接施工處理。

復合土工膜搭接施工一般有焊接、膠粘、折疊、重疊幾種方法，最常用是前兩種方法，因為可以更好的發揮性能：

膠粘法：用的土工膠將兩部分復合土工膜粘接在一起。膠粘法施工前將搭接部分擦干凈，均勻的刷一遍或者兩邊土工膠，然后用重物輥壓。

焊接法：焊接時最常用的搭接施工工藝，它是借助熱焊機等設備，將防滲膜加熱軟化，再通過焊機輥壓接合為一個整體。焊接法相較于膠粘更需要一些技術含量，通常焊接時技術人員會根據現場的情況和平時的施工經驗將復合土工膜邊緣留存一定的余量，以便后期焊接施工時更加的平順減少褶皺。

重疊法和折疊法：在一些對防滲要求不高的工程，也可使用這兩種方法。重疊法是將兩部分復合土工膜疊搭在一起。折疊法是將兩部分復合膜沿邊折疊兩次或三次，沒有甩邊的復合土工膜可參考此方法或有甩邊配合膠粘法。